An open API service providing repository metadata for many open source software ecosystems.

GitHub / ifremer-bioinformatics 13 Dépôts

Home page of tools made by Ifremer's Bioinformatics Core Facility (SeBiMER)

ifremer-bioinformatics/samba 📦

Standardized and Automated MetaBarcoding Analyses workflow (Mirror)

langage: Nextflow - taille: 109 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a environ 2 ans - étoiles: 12 - forks: 5

ifremer-bioinformatics/tools-iuc Fork de galaxyproject/tools-iuc

Fork of Tool Shed repositories maintained by the Intergalactic Utilities Commission

taille: 1,29 Go - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a 6 mois - étoiles: 0 - forks: 0

ifremer-bioinformatics/ToolDirectory

Dynamic visualization of softwares managed by a Bioinformatics Core Facility

langage: Python - taille: 2,24 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 4 - forks: 1

ifremer-bioinformatics/orson 📦

Workflow for prOteome and tRanScriptome functiOnal aNnotation. CAUTION : project has moved to Gitlab.

langage: Nextflow - taille: 1,2 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 5 - forks: 3

ifremer-bioinformatics/ifremer-bioinformatics.github.io

public web site of SeBiMER on Github

langage: JavaScript - taille: 144 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus d'un an - étoiles: 0 - forks: 2

ifremer-bioinformatics/celia

langage: Python - taille: 351 ko - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a environ 4 ans - étoiles: 2 - forks: 0

ifremer-bioinformatics/BeeDeeM-Tools 📦

Sequence management tools relying on the Bioinformatics Databank Manager System, BeeDeeM (miror).

langage: Java - taille: 23 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 0 - forks: 0

ifremer-bioinformatics/Katalog

The Katalog library aims at displaying list of softwares (or databanks) using facetted data visualization system

langage: JavaScript - taille: 8,43 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 0 - forks: 0

ifremer-bioinformatics/FLORA

workFLOw for Rnaseq analyses of the Amocyst project

langage: Nextflow - taille: 34,5 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 3 ans - étoiles: 1 - forks: 1

ifremer-bioinformatics/omics-catalog

A FAIR toolkit for fast visualization of omics data and metadata

langage: JavaScript - taille: 10,1 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 4 - forks: 0

ifremer-bioinformatics/pallor

langage: Nextflow - taille: 25,3 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a environ 3 ans - étoiles: 2 - forks: 1

ifremer-bioinformatics/Keshif Fork de adilyalcin/Keshif

Keshif - Data Made Explorable (Prototype)

taille: 109 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 5 ans - étoiles: 0 - forks: 0

ifremer-bioinformatics/BLAST-PLAST-bench

Scripts to run benchmarks of BLAST and PLAST on a supercomputer

langage: Shell - taille: 144 ko - dernière synchronisation: il y a environ 10 heures - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 0 - forks: 0