GitHub / openalea 82 Dépôts
OpenAlea is an open source project aimed at the plant research community. It includes modules to analyse and model growth and functioning of plant architectures
openalea/DSS
Repository containing DSS model code
langage: Jupyter Notebook - taille: 949 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 1 - forks: 0
openalea/weatherdata
Python data structure for handling weather data
langage: Jupyter Notebook - taille: 2,07 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 2 ans - étoiles: 3 - forks: 2
openalea/lpy
An open source python version of the Lindenmayer Systems.
langage: C++ - taille: 17,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 15 jours - étoiles: 79 - forks: 31
openalea/visualea
Visual Programming Workflow environment for OpenAlea
langage: Python - taille: 2,16 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 14 jours - étoiles: 4 - forks: 4
openalea/weberpenn
Implementation of the tree model published by Weber & Penn
langage: Python - taille: 445 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 14 jours - étoiles: 6 - forks: 1
openalea/scipack
Sientific Python wrappers for OpenAlea Visual Programming environment
langage: Python - taille: 18 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a 14 jours - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/grapheditor
A generic graph visualisation and interaction OpenAlea library
langage: Python - taille: 488 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 14 jours - étoiles: 2 - forks: 2
openalea/oalab
OpenAlea Laboratory
langage: Python - taille: 11,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 14 jours - étoiles: 1 - forks: 2
openalea/oawidgets
OpenAlea Widgets for Jupyter Kernel
langage: Python - taille: 62,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 6 jours - enregistré: il y a 15 jours - étoiles: 4 - forks: 4
openalea/stat_tool
Basic Statistical tools used by different Structure Analysis libraries.
langage: C++ - taille: 11,9 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 21 heures - enregistré: il y a 15 jours - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/plantgl
An open-source graphic toolkit for the creation, simulation and analysis of 3D virtual plants.
langage: C++ - taille: 22,1 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 16 jours - étoiles: 71 - forks: 23
openalea/mtg
Multiscale Tree Graph datastructure and interfaces
langage: Python - taille: 3,29 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 15 jours - étoiles: 15 - forks: 16
openalea/caribu
Eco-physiological model of light interception by plants
langage: Python - taille: 11,4 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 16 jours - étoiles: 9 - forks: 11
openalea/ArchiCrop
3D plant model that gives structure to crop model outputs
langage: Jupyter Notebook - taille: 238 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 9 heures - enregistré: il y a 12 jours - étoiles: 5 - forks: 0
openalea/PyRATP
RATP: Radiation Absorption, Transpiration and Photosynthesis
langage: GLSL - taille: 19,1 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 17 jours - étoiles: 5 - forks: 5
openalea/openalea
Official repository for OpenAlea. Other repos in the openalea organization contain things like the website, documentation, projects, etc.
langage: Python - taille: 40,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 6 ans - étoiles: 53 - forks: 17
openalea/adel
Characterization of 3D plant development for graminae crops
langage: Python - taille: 38 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 18 jours - étoiles: 20 - forks: 17
openalea/gallery
Gallery for OpenAlea project
taille: 4,34 Mo - dernière synchronisation: il y a 6 jours - enregistré: il y a 21 jours - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/spice
Photon mapping with python wrapper (Spectral Photon Interception in Controlled Environment)
langage: C++ - taille: 194 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a 24 jours - étoiles: 2 - forks: 3
openalea/vmango-lab
A tool for modeling mango tree growth, development, fruit production and architecture
langage: Jupyter Notebook - taille: 93,7 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a environ 2 ans - étoiles: 7 - forks: 8
openalea/hydroroot
Simulation of hydraulic root architecture
langage: Python - taille: 79,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 24 jours - étoiles: 2 - forks: 3
openalea/openalea.rtfd.io
OpenAlea main documentation site
langage: Jupyter Notebook - taille: 73,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 16 jours - étoiles: 7 - forks: 7
openalea/strawberry
Strawberry architecture analysis and reconstruction
langage: Jupyter Notebook - taille: 41,8 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 17 jours - étoiles: 16 - forks: 7
openalea/phenomenal
Phenomenal: An automatic open source library for 3D shoot architecture reconstruction and analysis for image-based plant phenotyping
langage: Python - taille: 50,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 25 jours - étoiles: 40 - forks: 16
openalea/hydroshoot
Hydroshoot model for 3D hydraulic architecture simulation
langage: Python - taille: 36,3 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 25 jours - étoiles: 20 - forks: 11
openalea/vmapplet Fork de jvail/vmapplet
taille: 1,91 Mo - dernière synchronisation: il y a 3 jours - enregistré: il y a plus d'un an - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/PyQGLViewer Fork de fredboudon/PyQGLViewer
PyQGLViewer is a set of Python bindings for the libQGLViewer C++ library which extends the Qt framework with widgets and tools that eases the creation of OpenGL 3D viewers.
langage: Python - taille: 320 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 25 jours - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/astk
Toolkit package for openalea
langage: Python - taille: 1,16 Mo - dernière synchronisation: il y a 6 jours - enregistré: il y a 25 jours - étoiles: 3 - forks: 5
openalea/action-build-publish-anaconda
langage: Shell - taille: 1,32 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 3 mois - étoiles: 6 - forks: 2
openalea/core
Core functionality of openalea
langage: Python - taille: 1,87 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ un mois - étoiles: 4 - forks: 8
openalea/libcaribu
C++ compiled extension of openalea.caribu
langage: C - taille: 1,41 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 21 heures - enregistré: il y a 22 jours - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/cookiecutter-openalea
Project template for openalea projects, designed according to openalea development guidelines
langage: Makefile - taille: 48,8 ko - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a environ un mois - étoiles: 1 - forks: 0
openalea/metafspm
Base classes for FSPM processes to define inputs, variables and components
langage: Python - taille: 304 ko - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a 23 jours - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/sequence_analysis
langage: Jupyter Notebook - taille: 10,6 Mo - dernière synchronisation: il y a environ 21 heures - enregistré: il y a 17 jours - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/StructureAnalysis
Plant structure analysis
langage: C++ - taille: 24,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 2 mois - étoiles: 5 - forks: 6
openalea/plantscan3d
An open-source GUI for reconstructing plant 3D architecture from laser scans.
langage: Python - taille: 55,7 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 26 jours - étoiles: 29 - forks: 11
openalea/RSML
RSML : The language of root architecture
langage: Jupyter Notebook - taille: 10 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 23 jours - étoiles: 3 - forks: 3
openalea/WheatFspm
WheatFspm is a Functional Structural Plant Model (FSPM) of wheat based on an innovative modelling framework for a better understanding of grass morphogenesis and C-N economy in interaction with environmental conditions.
langage: Python - taille: 108 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a environ 2 mois - étoiles: 14 - forks: 8
openalea/caribu_cpp
Compiled extension companion of openalea.caribu
langage: C - taille: 828 ko - dernière synchronisation: il y a environ 2 mois - enregistré: il y a 3 mois - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/eartrack
An imaging library to detect and track future position of ears on maize plants
langage: Jupyter Notebook - taille: 338 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 7 ans - étoiles: 10 - forks: 4
openalea/docker-stacks
Ready-to-run Docker images containing Openalea applications
langage: Dockerfile - taille: 86,9 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 3 mois - étoiles: 4 - forks: 2
openalea/conda-deploy 📦
Scripts for OpenAlea deployment using conda and/or docker
langage: Shell - taille: 1000 octets - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 9 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/.github
test organisation wide issue templates
taille: 22,5 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 mois - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/WALTer
WALTer is a 3D FSPM Wheat model
langage: Python - taille: 3,02 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 mois - étoiles: 6 - forks: 8
openalea/Root-CyNAPS
Root-CyNAPS : Root Cycling Nitrogen Across Plant Scales
langage: Python - taille: 116 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a 3 jours - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/phenotrack3d
Phenotyping Maize over time
langage: Python - taille: 111 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 9 mois - étoiles: 12 - forks: 3
openalea/fspm-utility
langage: Python - taille: 2,74 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a 23 jours - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/github-action-conda-build
A Github workflow to build your software package and publish to an Anaconda repository.
taille: 68,4 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 mois - étoiles: 3 - forks: 1
openalea/EpyMix
A Python Model to study Epidemic dilution and barrier factors in Mixture crops
langage: Jupyter Notebook - taille: 811 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 mois - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/openalea-components
Openalea components
langage: Python - taille: 51,3 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 6 mois - étoiles: 1 - forks: 7
openalea/rhizodep
RhizoDep is a functional-structural root model designed to simulate rhizodeposition processes as a function of root carbon balance.
langage: Python - taille: 103 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a 2 mois - étoiles: 4 - forks: 3
openalea/rose
Rose architecture reconstruction and light interception
langage: Python - taille: 91 Mo - dernière synchronisation: il y a 2 jours - enregistré: il y a 6 mois - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/sconsx
SConsX is an extension package of the famous SCons build tool.
langage: Python - taille: 412 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 8 mois - étoiles: 1 - forks: 6
openalea/phenomenal_clean
cleaned version of phenomenal (purged from unused image data)
langage: Python - taille: 83,3 Mo - dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 8 mois - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/phenotyping_data
Data from plant phenotyping platform primarly aimed at desmonstrating/testing opeanalea phenotyping packages
langage: Python - taille: 347 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 8 mois - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/deepberry
deep-learning algorithm to detect and segment berries on grapewine images
langage: Python - taille: 70,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 9 mois - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/agroservices
AgroService is a Python package that provides access to IPM Web Services (at least) and a framework to easily implement Web Services wrappers. This package is intended to be close to the webservice. Therefore the requests will have the same API that each web service.
langage: Python - taille: 378 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a 4 mois - étoiles: 3 - forks: 4
openalea/gafam
Growing AgroForestry with Apple in Mediterranean climate
langage: Jupyter Notebook - taille: 1,33 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ un an - étoiles: 2 - forks: 0
openalea/deploy
OpenAlea.Deploy support the installation of OpenAlea packages via the network and manage their dependencies.
langage: Python - taille: 630 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ un an - étoiles: 2 - forks: 7
openalea/PyCropML Fork de cyrillemidingoyi/PyCropML
CropML Python library
langage: Python - taille: 407 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 7 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/vpltk
langage: Python - taille: 411 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 3 ans - étoiles: 1 - forks: 1
openalea/fractalysis
3D Fractal Analysis. Application to Light Interception.
langage: Python - taille: 473 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 8 ans - étoiles: 1 - forks: 1
openalea/InfraPhenoGrid
A scientific workflow infrastructure for plant phenomics on the Grid
langage: Python - taille: 74,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 10 ans - étoiles: 2 - forks: 3
openalea/braceroot
langage: Jupyter Notebook - taille: 3,71 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 3 ans - étoiles: 1 - forks: 0
openalea/travis-ci Fork de StatisKit/travis-ci
Tools for Using Conda in Travis CI
langage: Shell - taille: 255 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 4 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/sigflow
Architectural Model of flowering on fruit trees
langage: Python - taille: 619 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 5 ans - étoiles: 2 - forks: 4
openalea/appveyor-ci Fork de StatisKit/appveyor-ci
Tools for Using Conda in AppVeyor CI
langage: Batchfile - taille: 185 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 5 ans - étoiles: 0 - forks: 1
openalea/openalea-recipes
Conda recipes for OpenAlea
langage: Shell - taille: 253 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 7 ans - étoiles: 2 - forks: 6
openalea/xml_representation Fork de AgriculturalModelExchangeInitiative/Crop2ML
Repository for options to describe a model unit in a declarative way. Imperative representation will be specific for each modelling framework.
langage: Java - taille: 1,9 Mo - dernière synchronisation: il y a 8 mois - enregistré: il y a environ 7 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/container
basic common datastructures
langage: Python - taille: 31,2 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 2 ans - étoiles: 0 - forks: 1
openalea/plantlab
OpenAleaLab extension "plant"
langage: Python - taille: 67,4 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 8 ans - étoiles: 1 - forks: 3
openalea/misc
Miscealnous Administrative tools for OpenAlea developers
langage: Python - taille: 1,58 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 4 ans - étoiles: 0 - forks: 2
openalea/deploygui
OpenAlea graphical installer
langage: Python - taille: 142 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 8 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/oapkg
langage: Python - taille: 48,8 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 8 ans - étoiles: 0 - forks: 1
openalea/lignum
OpenAlea / Lignum interface
langage: Jupyter Notebook - taille: 769 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a environ 8 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/provenance
Provenance related tools for openalea
langage: Python - taille: 26,4 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 9 ans - étoiles: 1 - forks: 2
openalea/wlformat
Workflow environment definitions
langage: Python - taille: 85 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 9 ans - étoiles: 0 - forks: 1
openalea/openalea-opencv
OpenAlea workflow for OpenCV
langage: Python - taille: 84 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 10 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/PkgIt
PkgIt is a python packaging tool for Windows.
langage: Python - taille: 313 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 10 ans - étoiles: 0 - forks: 1
openalea/openalea-website
repository for sources of documentation
langage: Python - taille: 840 ko - dernière synchronisation: il y a 9 mois - enregistré: il y a environ 11 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/openalea.github.io
build pages of th documentation
langage: JavaScript - taille: 246 ko - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a plus de 11 ans - étoiles: 0 - forks: 0
openalea/scanalea
Transition layer between PlantScan project and OpenAlea
langage: Python - taille: 1,5 Mo - dernière synchronisation: il y a 4 jours - enregistré: il y a presque 12 ans - étoiles: 3 - forks: 5