gitlab.pasteur.fr / mmmi-pasteur 10 Dépôts
mmmi-pasteur/hh_israel_sarscov2_delta2
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mmmi-pasteur/influenza-modified-filter
Code and data for the article "Integrating information from historical data into mechanistic models for influenza forecasting" by Alessio Andronico, Juliette Paireau and Simon Cauchemez
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mmmi-pasteur/covid19-guiana
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mmmi-pasteur/sars-cov-2-epidemics-in-partially-vaccinated-populations
Repository containing code and data for the paper by Bosetti et al. "Epidemiology and control of SARS-CoV-2 epidemics in partially vaccinated populations: a modeling study applied to France"
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mmmi-pasteur/covid19-ensemble-model
Code and data for the article by Paireau et al. "An ensemble model based on early predictors to forecast COVID-19 healthcare demand in France"
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mmmi-pasteur/agedynamics_sarscov2
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mmmi-pasteur/covidonneur
Codes and Data for the paper “SARS-CoV-2 IgG seroprevalence surveys in blood donors before the vaccination campaign, France 2020-2021”.
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mmmi-pasteur/wallisandfutuna
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mmmi-pasteur/covid19-departmental-model
Repository containing data for the paper by Paireau et al. "Impact of non-pharmaceutical interventions, weather, vaccination, and variants on COVID-19 transmission across departments in France"
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mmmi-pasteur/monitoring-infection
Repository containing scripts and data for the paper "Hozé et al., Lancet Public Health, Monitoring the proportion of the population infected by SARS-CoV-2 using age-stratified hospitalisation and serological data: a modelling study"
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mmmi-pasteur/covidvaccinationstrategies-france
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