tru/singularity-google-chrome

using Google Chrome with singularity

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tru/dot_files

my . * files

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tru/singularity-bootstrap

Singularity bootstrap files

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tru/docker-centos6-bazel

CentOS-6 x86_64 cocker image for bazel

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tru/centos-pasteur

random files to ease the use of CentOS locally

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tru/docker-centos6-tensorflow

docker image to build tensorflow on CentOS-6 x86_64

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tru/docker-centos7-tensorflow

docker image to build tensorflow on CentOS-7 x86_64

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tru/singularity-docker-centos6-tensorflow

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tru/singularity-docker-centos7-tensorflow

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tru/gitlab-virtualbox-runner

testing a dedicated virtualbox runner for gitlab

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tru/docker-alpine-ci

building an alpinelinux docker image for CI

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tru/BGA2017

Bioinformatics and Genome Analyses 2017 - http://meetings.embo.org/event/17-genome Previous events: http://webext.pasteur.fr/tekaia/BGA_courses.html

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tru/ISB2017

Pasteur Course on Integrative Structural Biology (ISB2017)

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tru/ISB2016

Insitut Pasteur - Integrative Structural Biology School - 2016

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tru/singularity-skype

Singularity(based on docker://debian) container to run skype

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tru/test-lfs

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tru/ISB2018

Pasteur Course on Integrative Structural Biology 2018

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tru/AEGIS2018

AEGIS2018 course practical

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tru/BGA2019

Bioinformatics and Genome Analyses 2019 - http://meetings.embo.org/event/19-genome-analyses Program at https://webext.pasteur.fr/tekaia/BCGA2019/BCGA2019_Prog.html Previous events: http://webext.pasteur.fr/tekaia/BGA_courses.html

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tru/dns-esmmc

/etc/hosts with locally defined aliases

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tru/ISB2019

EMBO Course on Integrative Structural Biology 2019 http://meetings.embo.org/event/19-structural-biology

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tru/python-django-template

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tru/PasTeX

Beamer (LaTeX) template really close to the official Pasteur pptx theme

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tru/12765-viralhostrangedb

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tru/c7-conda-lgarciac-cuda92

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tru/c7-conda-lgarciac-cuda101

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tru/depens

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tru/ubuntu-lts18.04-maestro

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tru/docker-c7-ci

building an centos7 docker image for CI

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tru/docker-c7-miniconda-ci

building a miniconda image based on centos7 for CI

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tru/docker-c7-miniconda-tf-gpu-ci

# building a tensorflow-gpu miniconda image based on centos7 for CI

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tru/docker-c7-miniconda-pytorch-cuda10.2-ci

building a pytorch-cuda10.2 miniconda image based on centos7 for CI

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tru/docker-c7-miniconda-pytorch-cuda11.1-ci

building a pytorch-cuda11.1 miniconda image based on centos7 for CI

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tru/docker-ubuntu-lts18.04-maestro-ci

building a minimal image based on Ubuntu LTS 18.04 for CI (based on the singularity recipe at https://gitlab.pasteur.fr/tru/ubuntu-lts18.04-maestro)

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tru/docker-ubuntu-lts18.04-miniconda-ci

building a miniconda minimal image based on Ubuntu LTS 18.04 for CI

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tru/alphafold

import from github

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tru/RoseTTAFold

This package contains deep learning models and related scripts for RoseTTAFold

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tru/docker-nvidia-cuda11-ci

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tru/alphafold-github

Open source code for AlphaFold.

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tru/localcolabfold

Docker build from https://github.com/YoshitakaMo/localcolabfold

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tru/os-tools-centos7

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tru/oneapi-basekit-devel-centos7

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tru/oneapi-hpckit-devel-centos7

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tru/conda-container-howto

Walkthrough from a conda command line installation to a container (docker or singularity) for maestro, Inception gpulab, reproduceable, sharing among colleagues. Work in progress.

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tru/conda-scikit-fda

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tru/oneapi-ci

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tru/docker-c7-oneapi-basekit-offline

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tru/singularity-alpine-ci

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tru/docker-singularity-alpine-ci

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tru/singularity-docker-cellpose

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tru/singularity-docker-aydin-gpu

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tru/pas-te-x-jdreo

Beamer (LaTeX) template really close to the official Pasteur pptx theme

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tru/singularity-docker-busybox

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tru/buildah-busybox

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tru/docker-c7-miniconda-pytorch-cuda11.3-ci

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tru/docker-c7-miniconda-pytorch-cuda11.3-jupyter-ci

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tru/singularity-lts20.04-ci

# building an Ubuntu LTS 20.04 singularity image for CI

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tru/singularity-docker-matlab-r2022a

docker and singularity containers for official matlab R2022a

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tru/docker-archlinux-ci

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tru/isb2022

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tru/docker-ubuntu-lts18.04-ci

building a ubuntu LTS 18.04 docker image for CI

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tru/installing-scipion3-miniconda3

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tru/alphafold-dialvarezs

https://github.com/dialvarezs/alphafold

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tru/masterclass-22-17

PLUMED Masterclass 22.17

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tru/gP2S

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tru/catgumag-alphafold

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tru/CBP2023

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tru/af2complex

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tru/docker-miniconda3-jupyter

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tru/singularity-miniconda3-jupyter

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tru/singularity-docker-miniconda3-jupyter

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tru/miniconda3-python310-pytorch-cuda11.7

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tru/miniconda3-python310-pytorch-cuda11.7-nightly

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tru/micromamba-py310-pytorch-cuda11.7

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tru/deltaVinaXGB

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