forgemia.inra.fr topics: R
scales/replication-chrocodiff
Replication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"
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sk8/sk8-apps/agroecosystem/sas/eom-4-soil-visualisation-tool
Cette application permet aux utilisateurs de visualiser les caractéristiques physicochimiques de plus de 100 produits, ainsi que de comparer entre eux différents produits avec des boxplots. https://eom-4-soil-visualisation-tool.sk8.inrae.fr/
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sk8/sk8-apps/ga/gabi/rosetta
Cette application permet l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre. https://rosetta.sk8.inrae.fr
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genotoul-bioinfo/mixKernel
mixKernel is a multiple kernel framework that allows to integrate multiple datasets of various types into a single analysis. The package is published on CRAN: https://cran.r-project.org/package=mixKernel
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baric/shiny-tutorial
Learn how to build a shiny application
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baric/quarto-shiny-sk8
Développement d’une petite application Shiny et déploiement de celle-ci avec sk8, animé par Amandine Velt (SVQV) et Joseph Tran (EGFV) [AG CATI BARIC La Rochelle, 26-28/03/2024] slides: https://baric.pages.mia.inra.fr/quarto-shiny-sk8 tutoriel: https://forgemia.inra.fr/baric/shiny-tutorial
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simlake/calibration_abc-rf-sa
R scripts for the calibration of complex ecological model using the method called ABC-RF-SA, based on Approximate Bayesian Computation with Random Forest and Sensitivity Analysis.
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gaev/usecases/jupyterhub-ubuntu-vbox
Creation and provisioning a virtual machine (Ubuntu/VirtualBox) containing The Littlest JupyerHub (TLJH)
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inter_cati_omics/hackathon_shiny_2020
Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020
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