forgemia.inra.fr / umr-astre 58 Dépôts
https://umr-astre.cirad.fr/ Mixed Research Unit Animals, Health, Territories, Risks and Ecosystems Cirad - Inra Montpellier, France
umr-astre/geonetwork
Networks/graphs with geo-localised nodes https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/geonetwork/
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/mapMCDA
Produce an epidemiological risk map by weighting multiple risk factors. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/mapMCDA/
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/topomatch
Match toponyms by similarity
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/arbocartoR
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/capiche
Epidemics at the interface between domestic and wild swines in Corse (ContActs Pigs CorsE). https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/capiche/
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sit-methods
https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 1 - forks: 0
umr-astre/force_of_infection_lidiski
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/guidelines/doc-references
Dépôt publique de documentation de référence sur logiciels, méthodes ou pratiques pour les chercheurs, collaborateurs et étudiants de l'UMR ASTRE. Contact : facundo.munoz@cirad.fr
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 1
umr-astre/manuscripts/mobility-and-ppr-diffusion-in-nigeria
dernière synchronisation: il y a 7 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/forgemia-tutorial
A self-paced course on git and Forgemia.
dernière synchronisation: il y a 6 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/smcr
Contrôle de versions; Gestion de données; Reproducibilité et données géographiques en R
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/guidelines/statstips
Source repository for https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/guidelines/statstips/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/arbocartoR-app
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/data-management
Slideshow on good practices in data management. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/data-management/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/2023_lidiski_data-management
Workshop on data management. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/2023_lidiski_data-management/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sit
Analyse mark-release-recapture data from Sterile Insect Technique (SIT) field experiments. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/interference-arn-ppr
Clinical studies of vaccine development for PPR. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/interference-arn-ppr/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/notification-delays
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sit-reunion
Population suppression using boosted-SIT technique in La Réunion. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-reunion/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/CameroonBatEbola_Public
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sit-sudan
https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-sudan
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/praps2-atelier1
Premier atelier régional du projet PRAPS II. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/praps2-atelier1.
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/crashbayes
Crash Course On Bayesian Regression Modelling. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/crashbayes/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/notions_stats
Stage de formation : « Notions de base en statistiques ». https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/notions_stats/
dernière synchronisation: il y a 6 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/spenvdt
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sentinel_nodes
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/uselessproject
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/gestion-donnees
Slideshow on good practices in data-management. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/gestion-donnees/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sit-indonesia
Analysis of Sterile-Insect Technique Mark-Release-Recapture and pilot population-suppression trial data from Indonesia. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-indonesia/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/cirad
Cirad institutional LaTeX package
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/presentations/mathematiques-et-statistiques-dans-la-recherche
Short presentation to showcase examples of the role of mathematics and statistics in scientific research. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/presentations/mathematiques-et-statistiques-dans-la-recherche
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/nimble-Weibull-Shrinkage
A short tutorial on (1) fitting basic Weibull survival models in NIMBLE, and (2) two types of shrinkage prior (Dirichlet-Laplace & Horseshoe) for Bayesian variable selection. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/nimble-Weibull-Shrinkage
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/presentations/reproducible-research-in-r
Slides for the session on Reproducible Research in R at MOOD's summer school 2022. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/presentations/reproducible-research-in-r Recording: https://av.tib.eu/media/13751
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/asf-challenge
Collaborative repository of the ASTRE team for the ASF challenge. https://www6.inrae.fr/asfchallenge/
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 1
umr-astre/training/sit
Training on Sterile Insect Technique. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/training/sit/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/training/evolution-rscript
Going from a analysis script, through a RMarkdown report, up to a _pipeline_-structured analysis with [`targets`](https://wlandau.github.io/targets/).
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/presentations/irruption-ai
Slides for the talk entitled "The irruption of the AI" at the 2022 conference of the Spanish Society of Statistics and Operations Research (SEIO), in Granda, Spain. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/presentations/irruption-ai
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/boosted-sit
Effect of boosted SIT on the apparent density of Ae. aegypti in La Reunion Island: a field experiment. Slides: https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/boosted-sit/Release_BGT.html
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/presentations/2022_fao_risk-validation
Présentation technique : Options pour la validation des cartes nationales des risques à l’aide des données nationales de surveillance. F Muñoz, R Lancelot (CIRAD). https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/presentations/2022_fao_risk-validation
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/presentations/2022_eufmd-seen_risk-validation
Technical presentation: Options for validating national risk maps using data from surveillance national programs. F Muñoz, R Lancelot (CIRAD). https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/presentations/2022_eufmd-seen_risk-validation
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/nimbletempdev
R package for modelling arthropod development rates (mean and variance) as a function of temperature in nimble. Adapted from the PhD work of Soledad Castano (http://www.theses.fr/223623849).
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/sit-design
Requirements and design of a R package for analysing data from Mark-Capture-Recapture experiments for the effective management of invasive _Aedes_ mosquitoes.
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/difuse
Projet Difuse Activite 1: Caractérisation de la diversité des pratiques et des points de vue des acteurs manifestant leur volonté de s’engager dans le changement face aux urgences socio-écologiques au sein la Recherche Pour le Développement.
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/cicr-vaccination
Collaboration project with the Red-Cross International Comitee (CICR) for providing scientific and technical support to PPR and PPCB vaccination activities.
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/confint_ratio
Confidence intervals for a ratio of variables. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/confint_ratio/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/asf-speed
A fork of asf-challenge, for studying host density effects on dissemination speed. Info about the ASF challenge can be found here https://www6.inrae.fr/asfchallenge
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/dockelet
Run Ocelet in a docker container.
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/stage_mlegray
Comparison of scaling procedures for the assessment of the risk of introduction in the context of the EuFMD project. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/stage_mlegray/
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/fmd_risk_validation
Validation of a qualitative risk assessment of Foot-and-Mouth Disease in Tunisia with observed data. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/fmd_risk_validation/
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/rvf_mrt
dernière synchronisation: il y a 7 mois - enregistré: il y a 11 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/culicoides-friction
Dispersion of _Culicoides imicola_ using friction maps https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/culicoides-friction
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/covid19-mortality
A quick overview of the changes of Covid-19 mortality in the most affected countries of the European Union + the United Kingdom and of Africa. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/covid19-mortality/
dernière synchronisation: il y a 6 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/amr-laos
Multiple Factor Analysis (MFA) of Knowledge-Attitude-Practice survey responses of Laos' farmers on Antimicrobial resistance.
dernière synchronisation: il y a 6 mois - étoiles: 0 - forks: 0
umr-astre/spreadrate
Estimate the spread-rate of epidemics https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/spreadrate/
dernière synchronisation: il y a 5 mois - étoiles: 0 - forks: 0